Nas usinas termelétricas Santa Cruz e Campos, localizadas no Estado do Rio de Janeiro, FURNAS realiza o monitoramento da qualidade do ar para determinar as taxas de emissão de poluentes, tais como dióxido de enxofre, dióxido de nitrogênio, monóxido de carbono e material particulado. A Empresa verifica se esses dados estão em conformidade com os padrões de emissão estabelecidos pela legislação ambiental brasileira. Tal monitoramento também permite que seja feita a modelagem, e consequente previsão, da dispersão atmosférica dos poluentes na área sob a influência dessas usinas.

Além disso, as usinas termelétricas monitoram seus efluentes líquidos por meio de programas implantados segundo as diretrizes estabelecidas pelo próprio órgão de controle ambiental (FEEMA).